โรงเรียนสามชัยวิเทศศึกษา ก่อตั้งขึ้น โดยกลุ่มชาวไทยเชื้อสายจีน ในจังหวัดสมุทรสาคร ซึ่งมีความห่วงใยเกี่ยวกับภาษาจีน เนื่องจากลูกหลานชาวจีนในปัจจุบันจะไม่ค่อยสนใจใช้ภาษาจีนในการติดต่อสื่อสาร ซึ่งนับวันภาษาจีนก็จะเลือนหายไป จะมีก็แต่ชาวจีนรุ่นเก่าๆ ที่ยังคงรักษา และใช้ภาษาจีนอยู่บ้าง ด้วยเหตุผลดังกล่าว จึงได้มีการรวมตัวกันของกลุ่มชาวไทยเชื้อสายจีนในจังหวัดสมุทรสาคร และคิดที่จะสร้างโรงเรียนสอนภาษาจีนขึ้นเพื่อให้คนรุ่นหลังและลูกหลานได้รู้จัก และรักษาวัฒนธรรมจีนให้คงอยู่ต่อไป ประการสำคัญอีกประการหนึ่ง คือ ภาครัฐ และภาคเอกชน สอนภาษาต่างประเทศอื่นๆ นอกจากภาษาอังกฤษได้ โดยเฉพาะภาษาจีน กำลังได้รับความนิยมเป็นอย่างมาก ซึ่งในอนาคตก็จะเป็นภาษาสากลที่ทั่วโลกนิยมใช้

ปี พ.ศ.2544 ได้เรียนเชิญ ดร.แสงชัย โสตถีวรกุล มาเป็นผู้นำในการดำเนินการจัดาร้างโรงเรียน และได้มีผู้จิตรศรัทธา 2 ท่าน มีความประสงค์บริจาคที่ดินโดยมีวัตถุประสงค์เพื่อสร้างเป็นโรงเรียน และมีสอนภาษาจีนรวมอยู่ด้วย และนี่คือจุดเริ่มต้นของการสร้างโรงเรียนนี้ขึ้นมา ผู้ที่บริจาคที่ดินสร้างโรงเรียน คือ นายสุพล พูลสุวรรณวิทย์ และ นายพงศ์เทพ พฤกษ์วัฒนากุล ซึ่งเป็นนักธุรกิจชาวมหาชัย บริจาคที่ดินให้จำนวน 6 ไร่ 1 งาน 27 ตารางวา เมื่อจะมีการสอนภาษาจีนก็ต้องเริ่มตั้งแต่เด็ก ซึ่งทำให้ไม่พอแก่การสอน โรงเรียนจึงซื้อเพิ่ม อีก 12 ไร่ รวมเป็นที่ดินสร้างโรงเรียนทั้งหมด 18 ไร่ 1 งาน 27 ตารางวา ตั้งอยู่เลขที่ 24/141 หมู่ที่ 3 ถนนสหกรณ์ ตำบลบางหญ้าแพรก อำเภอเมืองสมุทรสาคร จังหวดสมุทรสาคร

ได้รับการสนับสนุนงบประมาณ ดังนี้ 1.สมาคมสามัคคีธรรมภาวนา บริจาคให้ 5 ล้านบาท โดยมี คุณวัฒนา วัฒนพรมงคล เป็นนายกสมาคม 2.มูลนิธิน่ำ เก็ก สมุทรสาคร บริจาคให้ 5 ล้านบาท โดยมี คุณปราโมทย์ หะทัยธรรม เป็นประธานมูลนิธิ 3.โรงเจเช็งเฮียงตั๊ว ท่าฉลอม บริจาคให้ 5 ล้านบาท โดยมี คุณพงศ์เทพ พฤกษ์วัฒนากุล เป็นประธาน

จากการรวมตัวกันของกลุ่มชาวไทยเชื้อสายจีน จึงได้มีการก่อตั้งสมาคมมารองรับ ชื่อว่า สมาคมส่งเสริมและพัฒนาการศึกษาจังหวัดสมุทรสาคร และตั้งชื่อ โรงเรียนสามชัยวิเทศศึกษา โดยท่าน ดร.แสงชัย โสตถีวรกุล ได้รับเลือกเป็นนายกสมาคมและเป็นผู้ลงนามแทนผู้รับใบอนุญาตโรงเรียน

ในระยะเริ่มต้นได้มีการระดมทุนจากคณะกรรมการสมาคมและผู้มีจิตศรัทธาทั้งในจังหวัดสมุทรสาคร กรุงเทพมหานคร และจังหวัดใกล้เคียง ร่วมกันบริจาคก่อสร้างอาคาร จำนวน 3 หลัง คือ อาคารอำนวยการ อาคารอนุบาล และอาคาร 4 ชั้น ซึ่งได้รับการอนุญาตจากกระทรวงศึกษาธิการให้เปิดการสอน วันที่ 16 พฤษภาคม 2547 ในระดับชั้นปฐมวัยปีที่ 1 ถึง ชั้นประถมศึกษาปีที่ 3 โดยทางโรงเรียนได้มีการสอน 3 ภาษา คือ ภาษาไทย ภาษาจีน และภาษาอังกฤษ มีนักเรียนมาสมัครเข้าเรียน 497 คน

ปีการศึกษา 2548 ได้มีการขยายชั้นเรียนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 มีนักเรียนทั้งหมด 787 คน ปีการศึกษา 2549 ได้ก่อสร้างอาคารเพิ่มอีก 1 หลัง และได้รับพระบรมราชานุญาตให้ใช้พระนามว่า “อาคารฉลองครองสิริราชสมบัติครบ 60 ปี” ซึ่งใช้เป็นอาคารเรียนของนักเรียนระดับเตรียมอนุบาล และเป็นห้องประกอบกิจกรรมต่างๆ อาทิ เช่น ห้องสมุด ห้องวิทยาศาสตร์ ห้องปฏิบัติการทางภาษา ห้องโสตทัศนศึกษา ห้องดนตรไทย ห้องดนตรีสากล ห้องมินิเธียเตอร์ ห้องประชุมใหญ่ เป็นต้น

และได้ขยายชั้นเรียนในระดับมัธยมศึกษาตอนต้น ดังนี้ ปีการศึกษา 2549 ขยายถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1 ปีการศึกษา 2550 ขยายถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 2 ปีการศึกษา 2551 ขยายถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 ปีการศึกษา 2552 ขยายถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 4 เปิดสอน 2 โปรแกรม คือ โปรแกรมวิทย์-คณิต และโปรแกรมภาษาจีน-อังกฤษ ปีการศึกษา 2553 ขยายถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 5 ปีการศึกษา 2554 ขยายถึงชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 6 และมีนักเรียนจบการศึกษา ชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 6 เป็นรุ่นแรกในปีการศึกษา 2554